Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms