Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL7P80098 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL7P80098 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL7P80098 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL7P80098 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL7P80098 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL7P80098 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL7P80098 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL7P80098 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL7P80098 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL7P80098 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL7P80098 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms