Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms