Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLDN2P57739 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms