Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIPK4P57078 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms