Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ATP5EP56381 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ATP5EP56381 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
ATP5EP56381 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
ATP5EP56381 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ATP5EP56381 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
ATP5EP56381 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
ATP5EP56381 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms