Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GBX2P52951 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBX2P52951 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms