Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCR4P51679 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCR4P51679 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms