Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DAP3P51398 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DAP3P51398 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DAP3P51398 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DAP3P51398 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DAP3P51398 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DAP3P51398 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DAP3P51398 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms