Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSEN1P49768 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms