Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX2P48431 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX2P48431 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX2P48431 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms