Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC6A9P48067 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms