Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms