Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPGP40121 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPGP40121 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms