Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5C1P36542 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms