Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms