Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIP1P30622 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIP1P30622 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms