Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms