Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms