Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms