Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTR2AP28223 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms