Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMA4P25789 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms