Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB5AP20339 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms