Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD53P19397 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD53P19397 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD53P19397 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms