Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXB4P17483 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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