Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTN1P12814 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ACTN1P12814 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms