Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODC1P11926 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ODC1P11926 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ODC1P11926 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ODC1P11926 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ODC1P11926 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms