Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHRNB1P11230 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHRNB1P11230 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms