Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMC1P11047 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms