Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL3O95236 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL3O95236 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL3O95236 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL3O95236 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL3O95236 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL3O95236 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL3O95236 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL3O95236 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL3O95236 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL3O95236 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL3O95236 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL3O95236 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms