Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALX3O95076 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALX3O95076 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALX3O95076 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ALX3O95076 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALX3O95076 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALX3O95076 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALX3O95076 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALX3O95076 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms