Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFS4O43181 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms