Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4O14817 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TSPAN4O14817 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TSPAN4O14817 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TSPAN4O14817 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TSPAN4O14817 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TSPAN4O14817 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TSPAN4O14817 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4O14817 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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