Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLDN25C9JDP6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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