Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTOA8MTQ0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms