Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID3CA6NKF2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms