Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACOD1A6NK06 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACOD1A6NK06 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms