Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB13A6NJU9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms