Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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SH3BP1Q9Y3L3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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SH3BP1Q9Y3L3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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SH3BP1Q9Y3L3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1Q9Y3L3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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