Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM2AQ9Y2K7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms