Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAK1Q9UPV9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms