Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF8Q9UPP1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms