Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR3Q9UNL2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR3Q9UNL2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms