Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYNRGQ9UMZ2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYNRGQ9UMZ2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms