Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms