Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms