Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPASTQ9UBP0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms