Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSD3Q9NYI0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms