Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms