Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms